Michael Merickel
2018-10-16 8eed333343e4e9e7f11f3aee67299030d6bf2783
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
.. _wiki2_installation:
 
============
Installation
============
 
Before you begin
----------------
 
This tutorial assumes that you have already followed the steps in
:ref:`installing_chapter`, except **do not create a virtual environment or
install Pyramid**.  Thereby you will satisfy the following requirements.
 
* A Python interpreter is installed on your operating system.
* You've satisfied the :ref:`requirements-for-installing-packages`.
 
 
Install SQLite3 and its development packages
--------------------------------------------
 
If you used a package manager to install your Python or if you compiled your Python from source, then you must install SQLite3 and its development packages.  If you downloaded your Python as an installer from https://www.python.org, then you already have it installed and can skip this step.
 
If you need to install the SQLite3 packages, then, for example, using the Debian system and ``apt-get``, the command would be the following:
 
.. code-block:: bash
 
    sudo apt-get install libsqlite3-dev
 
 
Install cookiecutter
--------------------
We will use a :term:`cookiecutter` to create a Python package project from a Python package project template.  See `Cookiecutter Installation <https://cookiecutter.readthedocs.io/en/latest/installation.html>`_ for instructions.
 
 
Generate a Pyramid project from a cookiecutter
----------------------------------------------
 
We will create a Pyramid project in your home directory for Unix or at the root for Windows. It is assumed you know the path to where you installed ``cookiecutter``. Issue the following commands and override the defaults in the prompts as follows.
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
    cd ~
    cookiecutter gh:Pylons/pyramid-cookiecutter-starter --checkout 1.10-branch
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
.. code-block:: doscon
 
    cd \
    cookiecutter gh:Pylons/pyramid-cookiecutter-starter --checkout 1.10-branch
 
On all operating systems
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
If prompted for the first item, accept the default ``yes`` by hitting return.
 
.. code-block:: text
 
    You've cloned ~/.cookiecutters/pyramid-cookiecutter-starter before.
    Is it okay to delete and re-clone it? [yes]: yes
    project_name [Pyramid Scaffold]: myproj
    repo_name [myproj]: tutorial
    Select template_language:
    1 - jinja2
    2 - chameleon
    3 - mako
    Choose from 1, 2, 3 [1]: 1
    Select backend:
    1 - none
    2 - sqlalchemy
    3 - zodb
    Choose from 1, 2, 3 [1]: 2
 
 
Change directory into your newly created project
------------------------------------------------
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
    cd tutorial
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
.. code-block:: doscon
 
    cd tutorial
 
 
Set and use a ``VENV`` environment variable
-------------------------------------------
 
We will set the ``VENV`` environment variable to the absolute path of the virtual environment, and use it going forward.
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
    export VENV=~/tutorial
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
.. code-block:: doscon
 
    set VENV=c:\tutorial
 
 
Create a virtual environment
----------------------------
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
    python3 -m venv $VENV
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
Each version of Python uses different paths, so you will need to adjust the path to the command for your Python version. Recent versions of the Python 3 installer for Windows now install a Python launcher.
 
Python 2.7:
 
.. code-block:: doscon
 
    c:\Python27\Scripts\virtualenv %VENV%
 
Python 3.7:
 
.. code-block:: doscon
 
    python -m venv %VENV%
 
 
Upgrade packaging tools in the virtual environment
--------------------------------------------------
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
    $VENV/bin/pip install --upgrade pip setuptools
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
.. code-block:: doscon
 
    %VENV%\Scripts\pip install --upgrade pip setuptools
 
 
.. _installing_project_in_dev_mode:
 
Installing the project in development mode
------------------------------------------
 
In order to do development on the project easily, you must "register" the project as a development egg in your workspace. We will install testing requirements at the same time. We do so with the following command.
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
    $VENV/bin/pip install -e ".[testing]"
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
.. code-block:: doscon
 
    %VENV%\Scripts\pip install -e ".[testing]"
 
On all operating systems
^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
The console will show ``pip`` checking for packages and installing missing packages. Success executing this command will show a line like the following:
 
.. code-block:: bash
 
    Successfully installed Jinja2-2.8 Mako-1.0.6 MarkupSafe-0.23 \
    PasteDeploy-1.5.2 Pygments-2.1.3 SQLAlchemy-1.1.4 WebOb-1.6.3 \
    WebTest-2.0.24 beautifulsoup4-4.5.1 coverage-4.2 py-1.4.32 pyramid-1.7.3 \
    pyramid-debugtoolbar-3.0.5 pyramid-jinja2-2.7 pyramid-mako-1.0.2 \
    pyramid-tm-1.1.1 pytest-3.0.5 pytest-cov-2.4.0 repoze.lru-0.6 six-1.10.0 \
    transaction-2.0.3 translationstring-1.3 tutorial venusian-1.0 \
    waitress-1.0.1 zope.deprecation-4.2.0 zope.interface-4.3.3 \
    zope.sqlalchemy-0.7.7
 
Testing requirements are defined in our project's ``setup.py`` file, in the ``tests_require`` and ``extras_require`` stanzas.
 
.. literalinclude:: src/installation/setup.py
    :language: python
    :lineno-match:
    :lines: 24-28
 
.. literalinclude:: src/installation/setup.py
    :language: python
    :lineno-match:
    :lines: 48-50
 
 
.. _initialize_db_wiki2:
 
Initialize and upgrade the database using Alembic
-------------------------------------------------
 
We use :term:`Alembic` to manage our database initialization and migrations.
 
Generate your first revision.
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
    $VENV/bin/alembic -c development.ini revision --autogenerate -m "init"
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
.. code-block:: doscon
 
    %VENV%\Scripts\alembic -c development.ini revision --autogenerate -m "init"
 
The output to your console should be something like this:
 
.. code-block:: text
 
    2018-06-22 17:57:31,587 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1254][MainThread] SELECT CAST('test plain returns' AS VARCHAR(60)) AS anon_1
    2018-06-22 17:57:31,587 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1255][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:31,588 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1254][MainThread] SELECT CAST('test unicode returns' AS VARCHAR(60)) AS anon_1
    2018-06-22 17:57:31,588 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1255][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:31,589 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1151][MainThread] PRAGMA table_info("alembic_version")
    2018-06-22 17:57:31,589 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1154][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:31,590 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1151][MainThread] PRAGMA table_info("alembic_version")
    2018-06-22 17:57:31,590 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1154][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:31,590 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1151][MainThread]
    CREATE TABLE alembic_version (
           version_num VARCHAR(32) NOT NULL,
           CONSTRAINT alembic_version_pkc PRIMARY KEY (version_num)
    )
 
 
    2018-06-22 17:57:31,591 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1154][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:31,591 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:722][MainThread] COMMIT
    2018-06-22 17:57:31,594 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1151][MainThread] SELECT name FROM sqlite_master WHERE type='table' ORDER BY name
    2018-06-22 17:57:31,594 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1154][MainThread] ()
     Generating /<somepath>/tutorial/alembic/versions/20180622_bab5a278ce04.py ... done
 
Upgrade to that revision.
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
    $VENV/bin/alembic -c development.ini upgrade head
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
.. code-block:: doscon
 
    %VENV%\Scripts\alembic -c development.ini upgrade head
 
The output to your console should be something like this:
 
.. code-block:: text
 
    2018-06-22 17:57:37,814 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1254][MainThread] SELECT CAST('test plain returns' AS VARCHAR(60)) AS anon_1
    2018-06-22 17:57:37,814 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1255][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:37,814 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1254][MainThread] SELECT CAST('test unicode returns' AS VARCHAR(60)) AS anon_1
    2018-06-22 17:57:37,814 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1255][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:37,816 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1151][MainThread] PRAGMA table_info("alembic_version")
    2018-06-22 17:57:37,816 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1154][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:37,817 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1151][MainThread] SELECT alembic_version.version_num
    FROM alembic_version
    2018-06-22 17:57:37,817 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1154][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:37,817 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1151][MainThread] PRAGMA table_info("alembic_version")
    2018-06-22 17:57:37,817 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1154][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:37,819 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1151][MainThread]
    CREATE TABLE models (
           id INTEGER NOT NULL,
           name TEXT,
           value INTEGER,
           CONSTRAINT pk_models PRIMARY KEY (id)
    )
 
 
    2018-06-22 17:57:37,820 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1154][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:37,822 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:722][MainThread] COMMIT
    2018-06-22 17:57:37,824 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1151][MainThread] CREATE UNIQUE INDEX my_index ON models (name)
    2018-06-22 17:57:37,824 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1154][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:37,825 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:722][MainThread] COMMIT
    2018-06-22 17:57:37,825 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1151][MainThread] INSERT INTO alembic_version (version_num) VALUES ('bab5a278ce04')
    2018-06-22 17:57:37,825 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1154][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:37,825 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:722][MainThread] COMMIT
 
 
.. _load_data_wiki2:
 
Load default data
-----------------
 
Load default data into the database using a :term:`console script`. Type the following command, making sure you are still in the ``tutorial`` directory (the directory with a ``development.ini`` in it):
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
   $VENV/bin/initialize_tutorial_db development.ini
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
.. code-block:: doscon
 
   %VENV%\Scripts\initialize_tutorial_db development.ini
 
The output to your console should be something like this:
 
.. code-block:: bash
 
    2018-06-22 17:57:46,241 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1254][MainThread] SELECT CAST('test plain returns' AS VARCHAR(60)) AS anon_1
    2018-06-22 17:57:46,241 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1255][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:46,242 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1254][MainThread] SELECT CAST('test unicode returns' AS VARCHAR(60)) AS anon_1
    2018-06-22 17:57:46,242 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1255][MainThread] ()
    2018-06-22 17:57:46,243 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:682][MainThread] BEGIN (implicit)
    2018-06-22 17:57:46,244 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1151][MainThread] INSERT INTO models (name, value) VALUES (?, ?)
    2018-06-22 17:57:46,245 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:1154][MainThread] ('one', 1)
    2018-06-22 17:57:46,246 INFO  [sqlalchemy.engine.base.Engine:722][MainThread] COMMIT
 
Success!  You should now have a ``tutorial.sqlite`` file in your current
working directory. This is an SQLite database with a single table defined in it
(``models``) and single record inside of that.
 
 
.. _sql_running_tests:
 
Run the tests
-------------
 
After you've installed the project in development mode as well as the testing
requirements, you may run the tests for the project. The following commands
provide options to ``pytest`` that specify the module for which its tests shall be
run, and to run ``pytest`` in quiet mode.
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
    $VENV/bin/pytest -q
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
.. code-block:: doscon
 
    %VENV%\Scripts\pytest -q
 
For a successful test run, you should see output that ends like this:
 
.. code-block:: bash
 
    ..
    2 passed in 0.44 seconds
 
 
Expose test coverage information
--------------------------------
 
You can run the ``pytest`` command to see test coverage information. This
runs the tests in the same way that ``pytest`` does, but provides additional
:term:`coverage` information, exposing which lines of your project are covered by the
tests.
 
We've already installed the ``pytest-cov`` package into our virtual
environment, so we can run the tests with coverage.
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
    $VENV/bin/pytest --cov --cov-report=term-missing
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
.. code-block:: doscon
 
    c:\tutorial> %VENV%\Scripts\pytest --cov --cov-report=term-missing
 
If successful, you will see output something like this:
 
.. code-block:: bash
 
    ======================== test session starts ========================
    platform Python 3.6.5, pytest-3.6.2, py-1.5.3, pluggy-0.6.0
    rootdir: /<somepath>/tutorial, inifile: pytest.ini
    plugins: cov-2.5.1
    collected 2 items
 
    tutorial/tests.py ..
    ------------------ coverage: platform Python 3.6.5 ------------------
    Name                                Stmts   Miss  Cover   Missing
    -----------------------------------------------------------------
    tutorial/__init__.py                    8      6    25%   7-12
    tutorial/models/__init__.py            24      0   100%
    tutorial/models/meta.py                 5      0   100%
    tutorial/models/mymodel.py              8      0   100%
    tutorial/routes.py                      3      3     0%   1-3
    tutorial/scripts/__init__.py            0      0   100%
    tutorial/scripts/initialize_db.py      24     24     0%   1-34
    tutorial/views/__init__.py              0      0   100%
    tutorial/views/default.py              12      0   100%
    tutorial/views/notfound.py              4      4     0%   1-7
    -----------------------------------------------------------------
    TOTAL                                  88     37    58%
 
    ===================== 2 passed in 0.57 seconds ======================
 
Our package doesn't quite have 100% test coverage.
 
 
.. _test_and_coverage_cookiecutter_defaults_sql:
 
Test and coverage cookiecutter defaults
---------------------------------------
 
Cookiecutters include configuration defaults for ``pytest`` and test coverage.
These configuration files are ``pytest.ini`` and ``.coveragerc``, located at
the root of your package. Without these defaults, we would need to specify the
path to the module on which we want to run tests and coverage.
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
    $VENV/bin/pytest --cov=tutorial tutorial/tests.py -q
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
.. code-block:: doscon
 
    %VENV%\Scripts\pytest --cov=tutorial tutorial\tests.py -q
 
pytest follows :ref:`conventions for Python test discovery
<pytest:test discovery>`, and the configuration defaults from the cookiecutter
tell ``pytest`` where to find the module on which we want to run tests and
coverage.
 
.. seealso:: See ``pytest``'s documentation for :ref:`pytest:usage` or invoke
   ``pytest -h`` to see its full set of options.
 
 
.. _wiki2-start-the-application:
 
Start the application
---------------------
 
Start the application. See :ref:`what_is_this_pserve_thing` for more
information on ``pserve``.
 
On Unix
^^^^^^^
 
.. code-block:: bash
 
    $VENV/bin/pserve development.ini --reload
 
On Windows
^^^^^^^^^^
 
.. code-block:: doscon
 
    %VENV%\Scripts\pserve development.ini --reload
 
.. note::
 
   Your OS firewall, if any, may pop up a dialog asking for authorization
   to allow python to accept incoming network connections.
 
If successful, you will see something like this on your console:
 
.. code-block:: text
 
    Starting subprocess with file monitor
    Starting server in PID 44078.
    Serving on http://localhost:6543
    Serving on http://localhost:6543
 
This means the server is ready to accept requests.
 
 
Visit the application in a browser
----------------------------------
 
In a browser, visit http://localhost:6543/. You will see the generated
application's default page.
 
One thing you'll notice is the "debug toolbar" icon on right hand side of the
page.  You can read more about the purpose of the icon at
:ref:`debug_toolbar`.  It allows you to get information about your
application while you develop.
 
 
Decisions the cookiecutter backend option ``sqlalchemy`` has made for you
-------------------------------------------------------------------------
 
When creating a project and selecting the backend option of ``sqlalchemy``, the
cookiecutter makes the following assumptions:
 
- You are willing to use SQLite for persistent storage, although almost any SQL database could be used with SQLAlchemy.
 
- You are willing to use :term:`SQLAlchemy` for a database access tool.
 
- You are willing to use :term:`Alembic` for a database migrations tool.
 
- You are willing to use a :term:`console script` for a data loading tool.
 
- You are willing to use :term:`URL dispatch` to map URLs to code.
 
- You want to use zope.sqlalchemy_, pyramid_tm_, and the transaction_ packages
  to scope sessions to requests.
 
.. note::
 
   :app:`Pyramid` supports any persistent storage mechanism (e.g., object
   database or filesystem files). It also supports an additional mechanism to
   map URLs to code (:term:`traversal`). However, for the purposes of this
   tutorial, we'll only be using :term:`URL dispatch` and :term:`SQLAlchemy`.
 
.. _pyramid_jinja2:
   https://docs.pylonsproject.org/projects/pyramid-jinja2/en/latest/
 
.. _pyramid_tm:
   https://docs.pylonsproject.org/projects/pyramid-tm/en/latest/
 
.. _zope.sqlalchemy:
   https://pypi.org/project/zope.sqlalchemy/
 
.. _transaction:
   https://zodb.readthedocs.io/en/latest/transactions.html